两者的主要区别如下：

1. 评审申报条件不同。

2.员级职称:中等专业学校毕业,从事专业技术工作一年以上;其他符合评定条件人员。

3. 助理级职称:硕士研究生毕业,可直接评定;大学本科毕业,从事专业技术工作一年以上;大学专科毕业,从事专业技术工作三年以上;中等专业学校毕业,取得员级职称,从事专业技术工作四年以上;其他符合评定条件人员。

4. 评审先后不一样。先评审成为员级,再达到年限才可以继续审报助理级。

5. 学历起点不一样 。高中学历起点的报员级,本科起点的报助理级。

前者是教师最低一级，后者还不是老师

职称中员级是初级，助理是中级。

员级和助理级都是初级职称，但他们是有区别的，员级的岗位等级是十三级，而助理级的岗位等级是分为十一级和十二级。再看一下现在的工资结构，由岗位工资，薪级工资等组成的，由于员级和助理级在岗位上的不同，在兑现工资待遇时，助理级比员级高。

教师职称中的员级是指中小学三级，一般都是刚参加工作的年轻教师转正定级的时候才定为员级。而助理级是指中小学二级，中小学二级在教师职称中属于自然晋升，只要在员级岗位上达到一定的工作年限就可以通过考核认定。员级是享受十三级工资，而助理级是享受十二级工资。