学校源出两脉，一脉为1952年创办的重庆机电工业学校，历经重庆机器工业学校、第一机械工业部重庆机器制造学校、重庆第二机器制造工业学校、重庆第二机械工业学校、渝州大学等发展阶段。

一脉为1963年创办的重庆财贸干部学校，历经重庆财贸学校、重庆商学院等发展阶段。

2002年两脉合并组建重庆工商大学。有南岸校区（含兰花湖片区）、江北校区2个校区

重庆工商大学只有一所，没有两所，只是有两个校区：江北董家溪校区和南岸五公里校区。重庆工商大学是由两所大学（原渝州大学位于江北区董家溪和原重庆工商大学，位于南岸区五公里）合并而来因此现在有两个校区，而不是有两个不同的学校。