滨州医学院的前身是始建于1946年的原国立山东大学医学院，1956年独立建制为青岛医学院，1970年10月整体搬迁至山东省惠民地区行署驻地北镇办学，1974年11月设立青岛医学院北镇分院（为省属本科高等院校），1981年9月改称北镇医学院，1983年3月随驻地更名为滨州医学院。