大学英语四六级证书丢了可以在教育部考试中心综合查询进行网上申请补办，英语四六级考试是教育部主管的一项全国性的英语考试，其目的是对大学生的实际英语能力进行客观、准确的测量，为大学英语教学提供测评服务。