有害生物防治员证的费用因地区、培训机构、证书等级等因素而有所不同。

一般来说，基础级别的有害生物防治员证费用在500-800元左右，高级别的有害生物防治员证费用则在1000元以上。如果需要参加培训班，还需要另外支付培训费用。