根据我所了解的情况，公务员思想鉴定是对公务员的政治思想、道德品质、遵纪守法等方面进行评估和鉴定的程序。

在一些特定的情况下，公务员思想鉴定可以由相关部门盖章确认，以确保鉴定结果的真实性和权威性。然而，具体是否可以盖系里章，可能需要根据不同地区和部门的规定来确定。建议您咨询相关部门或查阅相关法规以获取准确的信息。

公务员思想鉴定可以盖系里的章，这相当于是学校给你出具的证明，具有效力。

根据国家有关规定，公务员思想鉴定的盖章应该是用公章或者是法定代表人章。而系里章并不是法定章，因此在公务员思想鉴定中不应该使用系里章。此外，公务员思想鉴定是一项非常重要的工作，需要严格遵守相关规定，以确保公正、公平、公开的评定结果。