DNA分子提取得到以后，需要通过电泳技术来检测其数量和质量。

自从琼脂糖和聚丙烯酰胺凝胶被引入核酸研究以来，按相对分子质量大小分离DNA的凝胶电泳技术，已经发展成为一种分析鉴定DNA分子的重要实验手段。琼脂糖或聚丙烯酰胺凝胶电泳是基因操作的核技术之一，它能够用于分离、鉴定和纯化DNA片段。该技术操作简单而迅速，已经成为许多通用的分子生物学研究方法，如DNA重组、DNA核苷酸序列分析、DNA限制性内切酶分析及限制性酶切作图等的技术基础。

凝胶电泳在电泳过程中将凝胶用作反对流介质或筛分介质，即带电粒子在电流中的移动。凝胶抑制了施加电场引起的热对流，还可以充当筛分介质，阻止分子通过。凝胶也可以简单地用于维持最终分离，从而可以应用电泳后染色。DNA凝胶电泳通常用于分析目的，通常是在通过聚合酶链反应（PCR）扩增DNA后进行的，但在使用其他方法（如质谱法、RFLP、PCR、克隆）之前，可以用作制备技术，DNA测序或Southern印迹进一步鉴定。