全日制的公办专科与独立学院的区别在于几个方面：

1、公办专科院校是专科学历，而独立学院本身是一所本科院校，因此主要以本科学历为主，也设立了专科专业，要招一些专科生。

2、公办专科性质是公办的，而独立学院的性质是民办的。

3、公办专科院校的学费要比独立学院低很多。

4、由于独立学院是民办院校，因此毕业后社会的认可度要低一些。

都是专科层次的高等教育，如果说区别，可能独立学院专科更偏于理论性学科教育，公办高职专科更偏于应用教学