二者范围不同，概念不同。

本科批指的是高考本科院校录取批次，它分为本科提前批、本科一批、本科二批、本科三批。在录取时间上，它们分别按顺序依次录取。普通批是相对于提前批而言的，指时间段比提前批要晚的批次。普通批次一般指本科一批、本科二批。

普通批包括本科一批 本科二批 高职高专批，本科批包括本科一批和本科二批