棋协是民间的团体组织，而棋院一般是文体局下属的国家事业单位。

比如说中国棋院，是国家事业单位，负责棋界的各项工作，有国家男女队和国少队的教练，负责训练棋手。还有负责其它事务的各处室等。而棋协是民间团体组织，人员组成是不坐班的。

棋协是指棋协会，每个地方都有，但就是个小协会，一般就挂个负责人的职务。

棋院的话规模就大了，棋院都是省级规模，有财政拨款的，一般棋院都有专业棋手，教练之类的人员配制。