学校创办于1937年9月，初名“私立莫厘补习中学”。

其后数易其名，校园也几度拓展。

2001年，学校通过市重点中学的验收；2005年，学校被江苏省教育厅命名为“三星级”重点高中；2009年3月，学校初高中分设，高中部正式定名为“苏州市吴中区东山中学”。学校占地53328平方米；有32个教学班，学生1688人，专任教师112人。

苏州东山中学有二个，其中一个初中和一个高中。