企业盘亏的库存商品不能直接处理。

根据会计准则规定，对于盘亏的物资和商品，要经过审批程序后才能处理。如果查明是保管员个人原因造成盘亏，个人应该承接相应的责任。之后才能进行账务处理。如果是不可抗力的原因造成盘亏，经过审批后按规定处理。如果是被盗等原因，应向公安部门报案，待案件处理后才能处理。