会计基础可分为权责发生制和收付实现制。

权责发生制要求，凡是当期已经实现的收入和已经发生的或应当负担的费用，无论款项是否收付，都应当作为当期的收入和费用。收付实现制是以收到或支付的现金作为确认收入和费用的依据。目前，我国企业会计的确认，计量和报告必须采用权责发生制；行政事业单位预算会计通常采用收付实现制，财务会计通常采用权责发生制。事业单位算和决算采用收付实现制。

根据财政部2012年颁布的事业单位会计准则“会计核算一般采用收付实现制，但部分经济业务或者事项的核算采用权责发生制”。也就是说事业单位也可以用权责发生制记账。

事业单位按可以分为全额事业单位、差额事业单位、自收自支事业单位。一般来说全额事业单位都是采用收付实现制，因为这类单位的经费来源全部来自上级拨款。