区别一:医药学院是以培养药学人才为主，而医学院是以培养临床类医学人才为主。

区别二:一般医药学院专业设置有药物制剂，药物工程、生物制药等相关专业为重点专业，其它专业为辅助专业。而医学院的专业设置主要有临床医学，口腔医学，麻醉学等相关专业。区别三:医药学院学生毕业以后主要在药店、制药厂等单位就业，而医学院毕业生主要在医院工作。

医药学院主要是医药，医学院主要临床医学