政府直属事业单位，正厅级，内设机构正处级，负责山东区域内南水北调工作。

国务院南水北调办为正部级，统管全国南水北调工作。水利部南水北调规划设计管理局为正局级事业单位，承担南水北调前期工作的组织、协调和管理工作，突出规划设计职能，业务上也要受国务院南水北调办辖制。