线粒体中存在RNA聚合酶，参与线粒体RNA的转录过程，但不论细胞核内，还是叶绿体或线粒体内的RNA聚合酶，抑或原核生物的RNA聚合酶，它们的合成都在细胞质中的核糖体上进行。

RNA聚合酶是催化以DNA为模板合成RNA(也就是RNA的转录)的酶，化学本质为蛋白质，在细胞质中的核糖体上合成，合成完毕后，一般经由核孔被转运进细胞核内，在细胞核内催化RNA的合成(转录)。