一级结构是空间结构的基础 ，蛋白质一级结构决定空间构象，即一级结构是高级结构形成的基础。

只有具有高级结构的蛋白质才能表现生物学功能。实际上很多蛋白质的一级结构并不是决定蛋白质空间构象的惟一因素。除一级结构、溶液环境外，大多数蛋白质的正确折叠还需要其他分子的帮助。这些参与新生肽折叠的分子，一类是分子伴侣，另一类是折叠酶。

蛋白质的一级结构是空间结构的基础,有什么样的一级结构决定了蛋白质分子采取何种空间结构,但只有少数比较简单的蛋白质可以完成自我折叠,多数蛋白质需要分子伴侣的帮助才能形成正确的空间结构. 通常一级结构相似的蛋白质其空间结构和功能也相似,反之,功能相近的蛋白质往往具有相似的空间结构及一级结构.