2003年4月，河南省教育厅批准新乡医学院和郑州三全食品股份有限公司合作试办新乡医学院三全学院。

2003年11月，依据教育部8号文件完成教育部和河南省教育厅重新备案审批；12月，教育部教发函正式确认学院为独立学院。

2011年11月，新乡医学院三全学院顺利通过河南省学位办学士学位授权单位评审，成为河南省首批获得学士学位授予权的独立学院。新乡医学院三全学院以前是三本，在高校录取批次合并之后成为第二批次招生。