新高考卷和全国甲乙卷的区别在于考试内容不同。

1. 新高考卷是根据国家新高考制度的要求而设计的考试卷，其主要目的是测试学生的综合素质，强调学生的创新能力和实践能力，所以与传统的全国卷有很大的不同。

2. 而全国甲乙卷则是由国家教育部通过教育部考试中心统一组织命题和出卷，并且将其分发到全国各地进行统一考试，主要测试学生对基础知识的掌握和应用能力，所以与新高考卷的考试内容还是有一定的差别。

3. 也就是说，新高考卷重视学生的素质培养，注重考查学生的思维能力和创新精神，而全国甲乙卷则侧重于基础知识、应用能力的考察。