西南大学公费生今年在云南分数较低的原因可能有以下几个方面：

首先，云南地区的高中教育水平相对较低，学生的基础知识储备相对较弱，导致他们在高考中的表现不如其他地区的学生；

最后，该地区的经济落后，家庭条件相对较差，很多学生在高考前没有得到充分的教育资源和支持。