如果两个学籍都是真的，不会影响高考。

但学籍系统查出学生有两个学籍后会让学校通知学生去处理掉不在读的那个。学籍是指一个学生属于某学校的一种法律上的身份或者资格，登记学生姓名的册子，专指作为某校学生的资格。

2013年9月1日起，全国已经初步建立了小中大学籍的信息管理系统。