办理食品经营许可证的程序主要有以下几个步骤：

1.填写食品经营许可证申请书，提出许可证申请；

3.县级以上地方食品药品监督管理部门应当根据情况对申请人提出的食品经营许可证申请进行处理；

4.县级以上地方食品药品监督管理部门受理申请人提出的申请决定的，应当出具受理通知书；决定不予受理的，应当出具不予受理通知书，说明不予受理的理由；

6.县级以上地方食品药品监督管理部门应当根据申请材料审查和现场核查，决定批准营业执照，自决定之日起10个工作日内向申请人颁发食品营业执照；不符合条件的，应当及时作出书面决定，说明原因。