上海交通大学医学院院系专业设置：临床医学院：临床医学(本博连读)、临床医学(本博连读法语班)、临床医学、临床医学(儿科学方向)、临床医学(英语班)。

口腔医学院：临床医学(本博连读口腔医学方向)、口腔医学。公共卫生学院：预防医学。基础医学院：医学技术类(生物医学科学、医学检验技术、食品卫生与营养学)护理学院：护理学(文、理)