正确的答案我认为应该是协议由甲方制作，因为它是出资方。

在实际工作中，一般甲方选定了乙方，下一步需要签订协议，而协议的条款由甲方制定，然后交给乙方进行协商，对于不符合规范要求的条款，及其它过分的条款，乙方有权以理拒争。直到双方满意为止。即可签订协议。

协议由甲乙方共同制作，一般由甲方执笔。