常熟理工学院有53个本科专业，涵盖工学、理学、文学、经济学、管理学、教育学、艺术学等7大学科门类。

其自动化、数学与应用数学、材料科学与工程、机械工程、自动化、计算机科学与技术以及师范类专业均是学校比较好的专业。