高座寺位于南京城南中华门外的雨花台。

始建于东晋初年，原名为“甘露寺”。据《金陵梵刹志》记载，东晋初年，西域沙门尸梨密多罗南渡来游建康，为丞相王导所敬重，于是在该寺讲经说法。由于他讲经时坐在高处，被人尊称为“高座道人”，时人于是也以“高座”为寺名。另一说法，高座道人后卒于建康，并葬于该寺，元帝为其树塔建冢，于是该寺改名为高座寺。