同源染色体体联会目的是是等位基因位置处于最近的状态。

配对是为接受后续减数分裂的挑选，将一对同源染色体分配到两个子代细胞，将一套遗传信息对等的分到两个细胞。如果不配对，就难以有效的均匀分配2n条染色体，使细胞生存的必要遗传信息均匀分配到子代。

同源染色体配对可进行部分基因的交换，这样形成的配子的种类是多种多样的。