从专业水平讲，南航的自动化和西电的电子信息不能相比，不在一个档次上。

南航的优势专业是飞行器设计、机械工程、电气自动化（相对好），而西电的优势是通信工程（国内领先）、电子信息工程和信息工程等。就业都没问题，看自己兴趣和今后目标吧。