40t锅炉脱硫脱硝的每年运行费用会受多种因素影响，包括所采用的脱硫脱硝技术和设备、燃料种类、锅炉规模等。

一般来说，脱硫和脱硝技术设备的购买、安装和维护成本较高，而运行费用则主要包括化学药剂和能源消耗。根据实际情况，估算40t锅炉脱硫脱硝的每年运行费用可能在几十万元到数百万元之间。具体的费用需要根据具体情况进行测算和评估。