这种情况一般来说是可以的。

大专辅导员通常要求是本科以上学历，此外就是具有当辅导员的能力，政治面貌一般要求党员或预备党员。可见，你是民办二本学生，但是学历层次已经达到了，如果符合当辅导员的能力，在民办二本里也入了党，那么是有资格当大专辅导员的。