共价修饰调节（英文名：covalentlymodulatedenzymes），是指共价调节酶通过调节酶的酶蛋白中某些氨基酸残基上共价结合或去除某些化学基团，从而使酶分子的共价结构和构象发生变化，使其处于活性与非活性的互变状态，从而调节酶的活性。