个体发育中，关键基因调节蛋白的表达，能引发一系列下游基因的表达，某些基因永久关闭，某些基因持续激活，从而诱导细胞沿某一分化途径增殖，导致特定谱系细胞的发育；具有这种正反馈作用的关键基因调节蛋白，通常称为细胞分化主导基因master control gene(MCG)。

如哺乳动物成肌细胞向肌细胞分化过程中，myoD基因起重要作用，是肌前体细胞分化成肌细胞的主导基因经myoD基因转染的成纤维细胞及其他类型的细胞，也能分化为肌细胞。