西南大学是教育部直属的全国重点大学，是教育部认定的六所免费师范院校之一，国家211工程建设高校，双一流世界一流学科建设高校，西南农业大学只是一所全日制普通高校，就不属于985，211，同时也不是双一流中的一流大学和一流学科，西南大学明显要优于西南农业大学。

西南大学是在2005年由原西南农业大学和西南师范大学合并组建。现目前西南农业大学已经不存在。现在的西南大学包含了以前的西南农业大学，成为西南大学南校区。如今的西南大学是国家综合类重点大学。学校综合实力在2022年校友会排名中排37位。