两所学校综合分析比较：不相上下。

一、南京大学的优势：学校占地面积大，创办时间早，师资力量强，教学硬件设施好，本科、博士的学科整体实力强，招收本地考生的人数占比高。

二、同济大学的优势：学校地理位置好，资金投入大，硕士的学科整体实力强，招生人数多，招收外地考生的人数占比高。

三、江苏省考生考上南京大学的难度更大，江苏省考生更看好南京大学。

这两个大学都很好，属于全国顶尖类学校，办学历史悠久，学风端正，地理位置优越。如果能考上这两个学校，结合自己感兴趣的专业，将来都会有不错的发展。