属于一本学院，镇江船艇学院是全军唯一一所培养陆空军船艇军官的专业院校，学院前身是上海公安学校的海上巡逻系。

1978年成立汽车管理学校附属舰艇大队，定点江苏镇江，1983年6月改建为陆军船艇技术学校。

1999年4月正式成立为镇江船艇学院。