云南高校毕业生档案去向查询主要有以下几种方式：

1. 对于毕业前签署了就业协议的同学，如果学校帮助转移档案，那么档案可能存放在工作地的人才市场。如果工作单位具备档案管理权限，那么档案将直接由单位管理。

2. 对毕业后暂未就业的同学来说，他们的档案可以到户籍所在地的人才市场查询。同时，因为有些学校可能会暂存档案，所以也可以先回校确认一下自己的档案是否还存放在学校，或者查询相关的转档记录来确定自己档案的确切位置。

3. 一些省份已经开启了网上报到证查询服务，通过输入个人信息就可以查询到报到证的信息。

4. 如果以上途径都无法找到档案，毕业生还可以尝试联系母校的教务处或者学生处，他们可能会有更详细的记录和帮助。

总的来说，查询档案需要结合个人的实际情况，通过各种途径进行排查，耐心细致的查找往往能找到答案。