江苏科技大学张家港校区和镇江本部的区别在于地理位置和专业设置。张家港校区位于张家港市，而镇江本部位于镇江市。张家港校区已更名为江苏科技大学苏州理工学院，提供的专业相对较少，规模较小，但学风较好，每年考研的比例很高 。