因办学成绩显著，学校多次受到市、省、国家体育行政部门和政府的表章彰和奖励，先后荣获“江苏省业余体育训练先进集体“全国青少年体育工作先进集体“全国业余训练先进集体”“全国群众体育工作先进集体”。

2004、2008、2012年连续三个奥运周期被被国家体育总局评定为“国家高水平体育后备人才基地2012年学校被江苏省教育评估院评定为“江苏省三星级中等职业学校”。

2012年学校再次被国家体育总局表彰为“全国业余训练先进单位”。

2014年学校被江苏省人民政府评为“第二届夏季青年奥运会先进集体

南通体育学校是一所非常优秀的学校,它有高水平的师资力量和丰富的教学设施,还有严格的教学管理体制,强调以体育竞技和特殊体育培养为主。该校在全国备受赞誉,学生受到国内外各大体育联合会的推荐,拥有众多优秀的校友。