抗原抗体反应的原理，对检查的每个细胞进行分子标记物检查，从而区别出不同细胞的数量和不同细胞的性质。

流式细胞仪是设计出一种很细的管道，每个细胞只能单个通过，同时由于不同的细胞分子表面携带有不同的标记物，当单个的细胞通过管道时，就会与相应的抗体发生抗原抗体反应，通过电脑系统处理，就能够计算出通过的细胞的数量以及这些细胞含有哪种分子表面物，这样就能够对细胞的性质来源和数量作出一个明确的诊断