这两个名称说的是同一所学校。以前该学校的名称是内蒙古自治区医学院，位于通道北街和新华西街的交汇口。后来学校更名为内蒙古自治区医科大学，新校址建设在了呼和浩特市最西端的金山开发区，原校址拆除并被医科大学附属医院扩建占用。

内蒙古自治区有内蒙古医学院、包头医学院、内蒙古民族医学院。

还没听说有内蒙古医科大学，不知您是从那里得知内蒙古医科大学这一说法的。

内蒙古自治区有内蒙古医学院、包头医学院、内蒙古民族医学院。

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