孔雀河名字的出现只有200年左右时间。历史上，它始终是桀骜不驯的塔里木河的分支，到了清代乾隆年间，南疆测绘地图时，情况还是这样。也因孔雀河是罕见的无支流水系，其唯一源头来自博斯湖后，又从湖的西部溢出。中上游河水平稳流淌、极少暴涨，经过博斯腾湖的沉淀，清澈见底，浪花朵朵，宛如孔雀开屏一般优美动人，故名孔雀河。

她流经塔什市，穿越铁门关峡谷，进入库尔勒市，再经尉犁，沿库鲁克山东流，最后，注入罗布泊，全程786公里