上海交通大学医学院既是211，又是985。上海交通大学医学院原先是由1952年全国高等学校院系调整合并而成的上海第二医学院；1997年，学校通过了“211工程”立项。

2005年，上海交通大学与上海第二医科大学合并，进入“985”高校行列。