南京中医药大学是一本。

南京中医药大学是教育部和江苏省共建的国家“世界一流学科建设高校”，是江苏省人民政府与国家中医药管理局共建高校、江苏省重点建设高校、江苏省高水平大学建设高校，是世界一流中医药大学建设联盟。

南京中医药大学在江苏既有第一批次招生也有第二批招生,所以严格意义上,该校是二本大学,只有全部都在第一批次本科招生。