考试的科目是一样的。专业硕士和科学硕士在考试的时候一样，都是通过国家统一的研究生入学考试来考取的。一般情况下，科学硕士的分数要高一些，专业硕士的分数要低一些。

学校按照一定的比例录取学生，如果本人不做说明，将高分数学生列入科学硕士，将低分数学生列入专业硕士。但是考试科目，考试内容，考试程序都是一样的。