学校专业设置以北京交通大学优势学科为基础，结合京津冀和环渤海区域经济社会发展需要，设有10个学院，开设38个本科专业，形成了以轨道交通类专业为特色，工程类、信息技术类、管理类专业为优势，工、管、经、文、艺有机结合、相互促进、共同发展的学科群。