如果已经考上了研究生，那么三方协议将不再有效。三方协议是毕业生、用人单位和学校三方在毕业前签订的协议，其主要目的是为了保障毕业生就业权益。然而，一旦毕业生决定继续深造，他们将不再有就业的需求，因此三方协议也将不再有效。如果想要保留自己的就业机会，可以在研究生入学前与用人单位协商解除三方协议，或者在研究生毕业后重新签订三方协议。