一般情况下按照要求进行正确的操作是不会有不良后果，就是正常的学籍异动如转学，休学，复学，学籍关键字修改等。

但如果出现不了解政策出现转学，比如初中三年级转学就不能享受指标生待遇，异地转学就不能参加本地高考或者所学教材不一致等后果。