1物质循环再生原理；2物种多样性原理；3协调与平衡原理；4整体性原理；5系统学与工程学原理：系统的结构决定功能原理；整体性原理。生态工程是从系统思想出发，按照生态学、经济学和工程学的原理，运用现代科学技术成果、现代管理手段和专业技术经验组装起来的，以期获得较高的经济、社会、生态效益的现代农业工程系统。