重庆身份证号码以5001和5002开头的区别主要代表不同的区划。

5001通常代表重庆市渝中区，而5002则代表重庆市万州区。因此，这两个开头的身份证号码是用来区分不同区划的，没有其他特殊含义。

具体来说，重庆市渝中区的身份证号码一般以5001开头，而重庆市万州区的身份证号码则以5002开头。这种区划代码的设定主要是为了方便管理户籍和人口信息。

值得注意的是，随着城市的发展和行政区划的调整，一些区划的代码可能会发生变化。因此，如果需要确认某个人的具体户籍信息，最好通过当地的户籍管理部门进行查询。