上海理工大学南汇校区建院于1997年，位于浦东新区（原南汇区）惠南镇。

南汇校区由上海理工大学与原南汇区人民政府联合筹建，全部校舍由南汇区兴建。

南汇校区只有一个学院，那就是上海理工大学基础学院。

基础学院的主要工作内容是：学生管理、教学管理和后勤协调。学院针对地处南汇、远离总部的特点，依靠总部和南汇区的大力支持，各专业学院的支撑，实现“育人、服务、管理”的办学宗旨。

2013年9月，上海理工大学基础学院从南汇校区迁至军工路1100号校区。自此，南汇校区取消。